控制全自动大型豆芽机器箱体内的温度，通常在全自动大型豆芽机器箱体内壁安装热感应器，如接触温度计、电阻温度计等，用来作为温度测量和调节装置的变压器，又可作为控制热源（如电热器）通断的电讯信号开关。
即全自动大型豆芽机器箱体内部温度达到培育豆芽所需的最佳温度（27度）时，热感应器就能自动发出信号，切断通电线路而停止加热。相反，当全自动大型豆芽机器箱体内部温度低于27度时，热感应器又能自动发出信号，接通电热线路而进行及时加热。
由于全自动大型豆芽机器在培育豆芽时可自动控制温度，使豆芽生长在适宜的恒温条件下，克服了手工操作时温度变化不定的某些弊端，从而促进了豆芽的生长，缩短了培育时间。
全自动大型豆芽机器的温度自动控制与调节范围，一般在18-35度之间，但实际使用时，多选用27度左右。
全自动大型豆芽机器生产豆芽的过程：
先将全自动大型豆芽机器的软塑料管或胶管将下水盘出水管引出，供排水用。在育芽箱上面垫上10厘米厚的物体，然后将喷水箱放在上面，用软塑料管或胶管将水箱与喷头导管相连接。
将全自动大型豆芽机器控制器“电源插头”接上220伏、50赫兹交流电，将育芽箱再接“控制电源”插头与控制器“控温电源输出”插座相接，再将全自动大型豆芽机器控制器控温旋扭定在所需温度上，全自动大型豆芽机器即可开始工作。特别简单省事。
为了保证控温精度的正确性，当全自动大型豆芽机器安装后，或经过一段时间使用后，可按下述方法校对控温精度：将全自动大型豆芽机器的感温探头和标准温度计紧挨在一起，放在全自动大型豆芽机器的育芽箱内的上层。将全自动大型豆芽机器的育芽箱进行控制加温后，开始校对控温器上的旋扭指示值，分别指在1、2、3、4、5等处的准确控制温度值。但旋扭指在“1”上以后，对全自动大型豆芽机器的育芽箱内进行控制加温，观察指示灯。开始加温时，“加温指示灯”亮，“恒温指示灯”不亮。加温一段时间后，当“加温指示灯”熄灭，而“恒温指示灯”亮时，即表示全自动大型豆芽机器的育芽箱内温度达到控制温度值，这是读出标准温度计上的数值，即是旋扭指在“1”处的控制恒定温度值，记录后继续往下校对，直到将1-5各档的实际控制温度值全部校对完毕为止。
将种豆按常规浸泡好后放入全自动大型豆芽机器的育芽箱内的下水盘上（下水盘安放时要尽量保持水平），再将感温探头插入育芽箱顶的探头架上，将全自动大型豆芽机器控温旋扭指在25-27度处。随后豆种开始萌发，此时可将自动喷淋间隔调到2-3小时喷淋一次，到芽长1厘米后，调到4-6小时配淋一次。调节的水温要比指定的温度高出3-5度，使喷水的温度与豆芽当时的温度基本一致为宜。
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